Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ddb2Q99J79 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ddb2Q99J79 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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