Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan1Q99J59 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms