Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf144aQ925F3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf144aQ925F3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf144aQ925F3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf144aQ925F3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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