Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo1Q924W9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo1Q924W9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms