Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EedQ921E6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EedQ921E6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EedQ921E6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EedQ921E6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EedQ921E6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EedQ921E6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms