Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms