Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms