Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klc3Q91W40 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms