Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms