Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms