Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms