Protein–RNA interactions for Protein: Q8R285

Vmn1r79, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r79Q8R285 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r79Q8R285 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms