Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1L4

Kdelr3, ER lumen protein-retaining receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr3Q8R1L4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelr3Q8R1L4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelr3Q8R1L4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms