Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms