Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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