Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc3Q8K3W3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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