Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prkd3Q8K1Y2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prkd3Q8K1Y2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prkd3Q8K1Y2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prkd3Q8K1Y2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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