Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms