Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms