Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog3Q8CI04 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog3Q8CI04 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms