Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ep400Q8CHI8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms