Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms