Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl11Q8CE33 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms