Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms