Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms