Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ska3Q8C263 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ska3Q8C263 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ska3Q8C263 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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