Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms