Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN9

Tmem87a, Transmembrane protein 87A, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87aQ8BXN9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem87aQ8BXN9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms