Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn17Q8BXA6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn17Q8BXA6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn17Q8BXA6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn17Q8BXA6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn17Q8BXA6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn17Q8BXA6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn17Q8BXA6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn17Q8BXA6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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