Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Usp38Q8BW70 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Usp38Q8BW70 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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Usp38Q8BW70 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Usp38Q8BW70 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Usp38Q8BW70 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Usp38Q8BW70 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Usp38Q8BW70 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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