Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Triml1Q8BVP1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Triml1Q8BVP1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Triml1Q8BVP1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Triml1Q8BVP1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Triml1Q8BVP1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Triml1Q8BVP1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Triml1Q8BVP1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Triml1Q8BVP1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Triml1Q8BVP1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Triml1Q8BVP1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms