Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms