Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Htatsf1Q8BGC0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Htatsf1Q8BGC0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Htatsf1Q8BGC0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms