Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms