Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpped1Q8BFS6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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