Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms