Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubp1Q811S7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubp1Q811S7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms