Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms