Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms