Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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