Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms