Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42bpbQ7TT50 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms