Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stk40Q7TNL3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms