Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms