Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms