Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stambpl1Q76N33 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms