Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms