Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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