Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms