Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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